El órgano de máxima responsabilidad del Centro Asociado a la UNED en Tenerife es la Junta Rectora del Consorcio, quien asume la responsabilidad del control y de señalar las directrices de funcionamiento del Centro, y que está integrado por los correspondientes representantes de las instituciones financiadoras:

• Cabildo de Tenerife.
• Consejería de Educación Cultura y deportes del Gobierno de Canarias.
• Ayuntamiento de La Laguna (desde el 8 de noviembre de 1999).
• Universidad Nacional de Educación a Distancia (UNED).
• Ayuntamiento de Santa Cruz de Tenerife (desde el 27 de julio de 2004).

Y también por un representante de los Profesores-Tutores, un representante del P.A.S., el delegado de los Alumnos y el Director del Centro.